Фамилия Zybenkov формируется из Zyba прозвища. По одной из версий, она берет свое начало в северных диалектах общих слов "zyba" - "колыбели, колыбели". Исходя из этого, можно предположить, что прозвище относится к числу Zyba «профессиональных» имен, содержащее указание на оккупацию основатель семьи: это может быть мастером на то, чтобы койки.
Возможно также, что прозвище Zyba этимологически связано с глаголом "zybat" - "трясти, трясти, лоскут". В этом случае прозвище Zyba мог получить нерешительный, робкий человек.
Скорее всего, название изначально пришли Zybenkov в Украине или Беларуси, о чем свидетельствует характерный суффикс-EHKO. Со временем, вероятно, родом Zybenko переехал в Россию, где не было русификации имен при помощи суффикса-ов. Zyba легли в основу семьи Zybenkov.
В XV-XVI веков, начинают передаваться от поколения к поколению, имена, в которых подчеркивается прав, принадлежащих к конкретной семье. В результате, прозвище человека укрепила его потомков и его семьи, оформляя с разными суффиксами. Zyba в конечном счете получил название Zybenkov.