Коротченя фамилия восходит к прозвищу Коротич, которая восходит к прилагательным "короткий". Обычно это древние славяне называли человеком маленького роста.
По другой версии, название Коротченя формируется не по прозвищу, но от мирских имен Коротич, который связан с именем злой дух сибирских Korochuna. По словам суеверных обычаев, существовавших в России, как и имена они носят детей, чтобы отвращение злых сил. Чтобы не искушать судьбу и принять зло, детям давали имена со значением прямо противоположным тому, что вы ожидаете или хотите родителей к детям. В этом случае, в надежде иметь красивые и здоровые мальчик, его родители могли бы назвать Коротич. Тем не менее, первая версия более правдоподобным. Коротич легли в основу семьи Коротченя.
Суффикс-Enya указывает на возможную украинского или белорусского происхождения фамилий. Коротич, в конце концов получил название Коротченя.