Фамилия Мусакаев формируется из мужчин тюркских Мусакаев имя.
Имя Мусакаев, в свою очередь, происходит от еврейско-арабском имени Муса с добавлением уменьшительно суффикса "-кай", характерный для кавказских семей тюркского происхождения.
По одному из вариантов перевода, имя Моисея имеет значение ", который делает чудеса." По другой версии, это название мусульманской версии еврейское имя Моисей означает "ребенок, сын." Таким образом, потомок человека, чье имя было Мусакаев в конечном счете получил название Мусакаев.