Фамилия происходит от прозвища брат Браткова. Тем не менее, в разных диалектах, он иной смысл: "двоюродный брат", "сводный брат" и "друг, товарищ". Скорее всего, основателя рода Братков образованные старшего брата.
В "Onomastikone" С. Б. Веселовского упоминается же корневое имя: Братухин Никита Никифоров, 1638, Москва; Братцево, землевладельцев, к концу века XV. и позже, Новгород. Брат, в конечном счете получил название Браткова.