Фамилия Бурхонов образуются от имени Бурхон. Это таджикском или узбекском версии название Бурхан.
По одной из версий, название Бурхан древнетюркского и переводится как "доказательство". Согласно другой гипотезе, это имя монгольского происхождения. В этом случае, она основана на монгольское слово "Бурхан" - "бог, божество". Бурхон в конечном счете получил название Бурхонов.