Фамилия Годунов формируется из прозвищ Годун, которая восходит к тем же общим названием. В диалектах Ярославль так называемый приемный ребенок, приемный ребенок, а в Украине и Беларуси - учитель, опекун. Однако в северных диалектах, как прозвище, данное взрослого человека, который заключен контракт на работу в течение года.
Вполне возможно, что в основе этого прозвища является глагол "godit", т.е. медлить, мешкать, ждать, ждать. В этом случае, позвоните Годунов может замедлиться, медлительность человека.
Прозвища и имена с основой "Годунов" весьма древнее. Таким образом, в "Onomastikone" С. Б. Веселовского упоминается Иван Годун Зернов конце века XIV., Ставший предком Годунова.
Известный владелец имени - Борис Годунов Федорович, боярин, брат-зять царя Федора Ивановича я, в 1587-1598 фактический правитель государства, с 17 февраля 1598 - царь России.