Калугин фамилия восходит к нарицательным "Калуга". Так что в старые времена был назван Карр. Возможно, это слово легло в основу названия древнего русского города на Оке. Скорее всего, предок владелец этой семьи был житель города, за которую он получил прозвище Калугин.
Менее вероятно, является гипотеза, согласно которой название образовано от слова "Калуга" в значении "большой рыбы, осетровых видов рыб". В конце концов получила название Калугин.