Основу названия было религиозное имя Kananyhin Конон. Kananyhin - фонетический вариант фамилии Kononykin. Она, в свою очередь, происходит от одной из форм имя Конон - Kononyka (это часто встречается в среде уральских казаков).
Само название Конон имеет греческое происхождение и означает "работать, трудолюбивые". В истории Православия известны пять святых с таким именем: Преподобный Конон, игумен Pentukla (день его памяти приходится на 4 марта), мученик Конон Исавр (18 марта), мученик Конон Конон и его сын (19 марта) и римского мученика Конон (18 июня).
Переменный гласных о / и из-за влияния "akayuschih" диалекты. Kononyka в конечном счете получил название Kananyhin.