Фамилия является короткой формой замороженных прозвища, которых этимология вполне понятно: обычно коротко называют человеком маленького роста.
В "Onomastikone" С. Б. Веселовского упоминается связанных прозвища и фамилии: Koroten В. Путилов, 1490, Василий, Матвей, и Третьяк Kushnik Korotnevy, выполненный в опричнину в 1570 году, короткие ноги Семен Давидович Данилов, Вторая половина XV века. В конце концов получил имя короткое.