За основу был Мануйлов имя религиозных имя Ему: Еммануил. Мануйлов фамилия формируется из крещении имя Ему: Еммануил мужчин распространено в старину. В переводе с еврейского это название означает "с нами Бог".
покровителем имени Мануэль (Emanuel) считался святой мученик Мануэля, который вместе с Феодосием пострадал за свою веру в Христа в 304 году в Срема. Один из римских правителей во время гонений на христиан вошел в святую в тюрьме, а затем приказал приостановить Мануэль и Феодосия в дерево, и брить их тела с острыми железными крючьями и затем отточенные на мучеников положить трезубцами и, наконец, обезглавлены.
Вполне возможно, что в основе названия лежало прозвище Мануйлов, который будет называться льстец и обманщик. Однако эта гипотеза маловероятна. Мануэль в конечном счете получил название Мануйлов.