Нага прозвища восходит к слову "голый" - "голый, обнаженный". Я полагаю, он назывался бедным человеком, который ходил в старой, изношенной одежде. Такое прозвище мог получить и нищий или банкротом фермера. В любом случае, имя Нагин содержит ссылку на социальное, финансовое состояние и основатель семьи.
В "Onomastikone" С. Б. Веселовского упоминает Г. Саймон Нага, вторая половина XV века;. От него, голые, Vol. Петр Васильевич Нага-Оболенский, XV века. Нага в конечном счете получил название Нагин.