Фамилия Pinneker образован из аналогичных прозвища. По словам одной из версий восходит к немецкое слово-Пинне \род; костыль; Нагель; Шпилька; кнопку \,\румпель\. Когда рычаг в верхней части по оси судна руль, который используется для передачи рулевого (поворота) на малых судах. Исходя из этого можно предположить, что основатель рода был матрос Pinneker.
Согласно другой версии, имя Pinneker еврейка, и прозвище Pinneker восходит к имени польского города Pniewy (Польская версия названия, Pniewy, немецкий-Пинне). Этот город в Великопольское воеводство, Шамотульский повят и находится недалеко от Познани. В данном случае, Pinnekerom в prozvat′ города. Среди известных держателей это название – Pinneker Евгений Викторович, гидрогеолог и geohimik, член Российской академии наук.