Фамилия Полубояринов формируется из прозвищ. Полупанов или Полубариновым, Полубояринов в старину называли обедневшего дворянина, который был вынужден сам часто обрабатывать свои земли. Таким образом, это название содержит указание социального статуса предка.
В "Onomastikone" С. Б. Веселовский отметил: Полубояров Федор посадский людей в 1623 году, Гороховец; Полубояринов, 1629; Полубояринов Ивашка помещика 1567. Полубояринов в конечном счете получил название Полубояринов.