За основу был имя Филонин религиозное имя Филон. Крещении имя Филон человек по-гречески означает "любящий". Основе одноименного пошел к своему уменьшительная форма - Филона.
Известный владелец имени Фило Фило (родился около 25 г. до н.э., Александрия - умер в 50 года нашей эры) - выдающийся представитель еврейского эллинизма, который был в центре Александрии, богослов, апологет иудейства и религиозный мыслитель, оказал большое влияние на последующее богословие его экзегетических метод и его учение о Логосе.
По другой версии, название формируется из прозвище Филонин Фило, которая восходит к нарицательным "Фило", то есть "ленивым". Филон, в конечном счете получил название Филонин.