За основу был имя Фильков религиозное имя Филипп. Фильков фамилия восходит к церкви мужской имени Филипп, который в переводе с греческого означает "любитель коней". Это имя имеет ряд производных от разговорной формы, одна из них - Фил, - и легли в основу семьи.
святой покровитель этого имени является мученик Филипп Апамеи. Он проповедовал слово Божие, в Греции, Эфиопии и других стран, после агонии был распят вниз головой.
сам отчество фамилия Фильков второго порядка Фильков - сын Шарый, в внук Фили. Суффикс-ко может указывать на украинском или белорусском происхождении этого имени. Фил в конечном счете получил название Фильков.