Шарафеев фамилия восходит к мусульманской мужской Шарафи имя. Это имя может быть диалектное вариант названия Шарафутдинов (Шараф аль-Дин), который по-арабски означает "слава веры". Кроме того, не исключено, что имена легли в основу полной арабское название Шарафи, что означает «милый, дорогой, известный, знаменитый" или "благородный, благородной крови».
Скорее всего, имя было первоначально звучало как Sharafieva, и впоследствии адаптирована к русскому языку и была написана как Шарафеев. Шарафи, в конце концов получил название Шарафеев.