Фамилия Шестиперов формируется из прозвищ Шестиперов. Она берет свое начало из того же нарицательным, что, в Костроме диалект имеет значение "sherstobit", то есть "тот, кто кнутами волос." Очевидно, что прозвище относится к числу Шестиперов «профессиональных» имен, содержащее указание на оккупацию основатель семьи.
Согласно другой гипотезе, прозвище Шестиперов этимологически связано со словом "Шестоперов» - так называется старая русская краями шок оружие XIV-XVII веков. Это был своего рода булаву, на голове которого было шесть сварных металлических пластин - "перьев". В этом случае Шестиперов могли окрестить воина или мастера по производству оружия. Шестиперов легли в основу семьи Шестиперов. Шестиперов в конечном счете получил название Шестиперов.