Фамилия Шищенко формируется из прозвищ Shisch, которая восходит к глаголу "шиша". В "Толковом словаре русского языка" В. И. Даля, он рассматривается как "копать, беспокоить". Вероятно, это прозвище указывает на особый характер и поведение родителей (старательный, трудолюбивый). Согласных в / в результате фонетических процессов в языке.
Возможно также, что основой является ником другого глагола "shistat", то есть "болтовней". В этом случае прозвище Shisch мог получить разговорчивым человеком.
Согласно другой гипотезе, название происходит от нарицательного «поднять». Интересно, что последнее слово удар, чем прямое значение и имел в руках, "человек, идущий во главе лодочников". Исходя из этого, можно предположить, что предок был уважаемым человеком Shischenkovyh, пожалуй, лидер какой-либо движения.
Скорее всего, название изначально пришли Шищенко в Украине или Беларуси, о чем свидетельствует характерный суффикс - EHKO. Со временем, вероятно, родом Шищенко переехал в Россию, где не было русификации имен при помощи суффикса-ов. Shisch в конечном счете получил название Шищенко.