Фамилия образована от прозвища Шубникова Шубникова. Скорее, речь идет о так называемых «профессиональных» имен содержащей ссылку на деятельность человека (на что указывает суффикс-ник). Таким образом, можно предположить, что называется Шубникова меха мастер шитья.
Это была верхняя одежда, как много пословиц и поговорок: "По шерсти животных будут учиться, и человек не знает", "Меха от холода, деньги nuzhu", "зима пальто без стыда, и холодно и без пальто и теплый хлеб, а голодные "и т.д.
В "Onomastikone" именами С. Б. Веселовского семьи упоминаются: шуба Анания Максимович, 1535, Пошехонье; Shubarnikov Vohno, фермер, в 1559 году, Obonezhe; Шубинского Ратман Т., Новик, оставив сына незнакомец, в 1596 году, Углич, Шубинский, к концу века XVI. и позже, Углич. А. В. Шубникова, в конце концов получил название Шубникова.