Губенко фамилия формируется из личного прозвища и относится к распространенным видом украинских фамилий, о чем свидетельствует суффикс-EHKO.
славян древних времен существовала традиция давать человеку прозвище в дополнение к название он получил при крещении. Это было связано с тем, что церковь имен было сравнительно мало, и они часто повторялись. Его прозвище, допускается, чтобы легко найти человека в обществе. Это было очень удобно, потому что запас прозвищ было поистине неисчерпаемы. Источники могут быть: указание на особенности характера или внешности, национальности или местности, обозначение человека, который исходит от человека, которого он был. Иногда прозвища, изначально присоединения крещении имена, названия полностью вытеснить не только в повседневной жизни, но в официальных документах.
Последнее Губенко формируется из прозвище Bay - так называют в России, или толстые губы, обидчивый человек. Фамилия довольно старая, о чем свидетельствуют документы XV-XVII веков. Где упоминаются: Джон Губенко, фермер, в 1495 году, Новгород, Иван Губенко гость, сплющенные в 1555 году, чтобы жить в Казани, Алексей Иванович, дворянин, потомок выходца из Смоленска, 1610; Губенко Джон, фермер, 1627 Это были притяжательные прилагательные с суффиксами-ик / нед-,-EHKO, первоначально указывающие на прозвище отца. Губан, в конце концов получил имя Губенко.