Фамилия Конотоп имеет украинское происхождение. Скорее всего, это связано с городом Конотоп (Сумская область). Он расположен на реке Ezuch (приток Сейма).
Новоселица поселение было основано украинскими казаками в начале XVII века. Первое упоминание о городе относится к 1635 году, в 1642 году крепость была построена здесь и назван в честь реки Konotopka.
В 1659 году в городе и его окрестностях взял Конотоп битва между татаро-казачьего гетмана Выговского армии, которая нарушила решение Переяславской счастливой 1654 году, и московское войско Трубецкого. Конотопа в 1782 году получил статус города.
вероятно, предок имя владельца долгое время жил в этом городе, за которую он получил прозвище Конотоп. В конце концов получила название Конотоп.