Фамилия Lyapahin формируется из прозвищ Lyapaha, который, вероятно, восходит к глаголу "lyapat" необходимости "сделать грубо, как-то, поспешно", "пощечина, шлепок". Как правило, это прозвище назвать неумелых, неопытных сотрудников. Менее вероятно, что прозвище было Lyapaha небрежно, неряшливо людей.
Возможно также, что в основе прозвище Lyapaha диалектные нарицательным "ляп", который, в диалекте Архангельской означает "деревянный молоток, чтобы убить рыбу, особенно трески". В этом случае прозвище относится к числу Lyapaha «профессиональных» имен содержащей ссылку на деятельность предков: он мог быть рыбаком или плотником.
Прозвища с основой "бу-бу", очень древняя. Таким образом, в письменных источниках упоминания: Костромской крестьянин Иван Lyapa (1494), Новгородский крестьянин Grihno Ляпин (начало XVI века); Ustiuzhskii Арчер Lyapihin Юрий Ларионов (1632), Костромской posluh Lyapugin Степан (1485), посол римского царя Ляпунова Б. Осинин (1527), арендодатель Ляпунова Янович М. П. Мусоргского (1550). Lyapaha легли в основу семьи Lyapahin.